Cinqüenta anos atrás, um gigante extraterrestre de luz conhecido como Ultraman salvou a Terra, mas desapareceu. O anfitrião humano de Ultraman, Shin Hayata, ficou sem memória de seu tempo como herói. Shinjirou, o filho mais novo de Hayata, nasceu com um corpo mais poderoso e durável do que qualquer ser humano normal. A organização que ajudou Ultraman, o SSSP, revela o passado de Hayata para ele. Seu pai então veste um traje de poder novamente, assumindo o papel de Ultraman mais uma vez. Uma noite, Shinjirou é atacado por um alienígena chamado Bemular e resgatado por seu pai, que está gravemente ferido na batalha. Com alienígenas perigosos à espreita na cidade e Hayata fora de serviço, cabe a Shinjirou pegar a tocha. Mas, ao trabalhar com o SSSP como o novo Ultraman, Shinjirou se pergunta o quão longe ele está disposto a ir para ajudar as pessoas.